Stowarzyszenie powstało w roku 1949 i zostało zarejestrowane w Stanie Illinois jako Stowarzyszenie Samopomocy Nowej Emigracji Polskiej w Chicago (Mutual Aid Association of the New Polish Immigration in Chicago) 27 września 1950 roku. W roku 2003 został poprawiony Statut i zmieniona nazwa organizacji. Obecnie Stowarzyszenie ma nazwę: "Stowarzyszenie Emigracji Polskiej" - (SEP), a urzędowa nazwa organizacji w języku angielskim jest Polish Immigration Association.

Od samego początku organizacja jest klasyfikowana przez Urząd Podatkowy USA jako nie przynosząca dochodu (501 c4 under IRS code). Organizacja ma swoją siedzibę w budynku Polskiej Szkoły przy parafii Świętej Trójcy. Celem działania od samego początku było niesienie różnego rodzaju pomocy (za wyjątkiem materialnej) polskim emigrantom lub Amerykanom polskiego pochodzenia mieszkających w aglomeracji chicagowskiej, którzy znaleźli się w potrzebie. Stowarzyszenie prowadzi poradnictwo w zakresie świadczeń Social Security, poradnictwo emigracyjne i prawne (będące w zakresie kompetencji Biura Prokuratora Generalnego Illinois), pomoc przy wypełnianiu różnego rodzaju druków, informacje o działalności urzędów stanowych i miejskich. Ogromnie ważną rolę w działalności kulturalnej i edukacyjnej stowarzyszenia pełni biblioteka. Biblioteka liczy ponad 14000 książek w języku polskim z różnych dziedzin wiedzy. Stowarzyszenie prowadzi także działalność edukacyjną z zakresu obsługi komputerów oraz sekcję szachową, propagującą grę w szachy wśród młodzieży i dorosłych. Organizuje ona również turnieje szachowe dla dzieci, młodzieży i osób dorosłych.

Liczba członków w różnych okresach ulegała zmianie. W chwili obecnej zarejestrowane jest w stowarzyszeniu około 100 członków, którzy swoim członkostwem wspierają działalność organizacji.

Prezesem SEP obecnie jest Andrzej Zgiet, wiceprezesami są Henryk Turzański i Ludwik Szczepanik, kapelanem jest ks. Paweł Bandurski SCh.

Organizacja w 2005 roku obchodziła pięćdziesięciopięciolecie działalności. Prezes Organizacji, Andrzej Zgiet dnia 14 października 2005 otrzymał nagrodę dziedzictwa przyznaną przez skarbnika Stanu Illinois, Judy Baar Topinkę za działalność na rzecz środowiska polonijnego w Chicago.

Działalność stowarzyszenia jest ściśle związana z życiem parafii. Prezes SEP jest członkiem Rady Parafialnej, niektórzy członkowie należą również do innych organizacji działających przy Parafii p.w. Świętej Trójcy, np.: chóru i klubu seniora. Stowarzyszenie przygotowuje zwykle rozgrywki szachowe dla dzieci, młodzieży i dorosłych na corocznych festiwalach parafialnych.